作為微孔板比色計的酶標儀，其基本功能不外乎一個比色測定，所不同的是在測定波長范圍、吸光度范圍、光學系統、檢測速度、震板功能、溫度控制、定性和定量測定軟件功能等方面的差異，當然全自動酶免疫分析系統還具有自動洗板、溫育、加樣等功能。在臨床實驗室實際工作中，實驗人員在使用酶標儀進行測定操作時，有時難免會對酶標儀的一些性能指標產生迷惑，甚對酶標儀的應用產生錯誤的理解。如諸如使用酶標儀較用肉眼觀察測定的陽性率明顯增加這樣的問題。

一、測定波長目前國內常見的ELISA試劑盒所使用的標記用酶均為辣根過氧化物酶（HRP），底物通常為四甲基聯苯胺（TMB）和鄰苯二胺（OPD），其在過氧化氫溶液的存在下，經HRP作用，分別氧化為2,2,-二氨基偶氮苯（DAB）和聯苯醌。。除了這兩個基本濾光片外，考慮到雙波長比色的需要，還應有620nm或630nm或650nm和405nm波長的濾光片，其他濾光片可根據自己的需要選擇。有時，有的實驗室希望用酶標儀作微量生化測定，故酶標儀生產廠家對其生產的 酶標儀擴展了紫外檢測功能，此時需要一個340nm波長濾光片。

二、測定的吸光度范圍通常，酶標儀的吸光度測定范圍在。對于酶標儀的吸光度范圍不必去刻意追求大的吸光度范圍，主要要看在一定的吸光度范圍內的線性和精密度如何。

三、光學系統酶標儀的光學系統采用的是垂直光路多通道（通常為8或12通道，亦有單通道）檢測，一般為硅光管或光導纖維，除測定通道外，有的酶標儀還有一個參比通道，每次測定可進行自我校準。 酶標儀的光學系統功能如何，均可通過酶標儀測定的吸光度范圍、線性度、精密度和準確度等體現出來。光學系統好的話，則上述指標也應較佳。測定的精密度與測定通道之間的均一性有直接關系。單通道可避免因通道不同所致的差異。